巩留县共有幼儿园65所（2所无学生教师），学校32所（小学25所、初级中学2所、九年一贯制学校3所、高级中学1所、职业技术学校1所），另有教学点9个、分校区4个。

全县现有在校生37624人（幼儿园5051人、小学19039人、初中9491人、高中3782人、职业技术学校261人），其中寄宿生11297人（小学677人、初中6643人、高中3734人、职业技术学校243人）；教学班级1026个（幼儿园217个、小学530个、初中197个、高中72个、职业技术学校10个)。少数民族学生32653人，占比86.79%。

全县现有教职工3591人（幼儿园955人、小学1451人、初中788人、高中358人、职业技术学校39人）；专任教师2386人（幼儿园429人、小学1133人、初中561人、高中243人、职业技术学校20人）。少数民族教师2191人，占比61.01%。

2023年10月，巩留县义务教育巩固率98.27%，高中阶段毛入学率98.40%，小学入学率100%，初中入学率100.76%，小学巩固率99.85%，初中巩固率99.71%，学前三年入园率99.91%。