巩留县位于新疆维吾尔自治区西北部，地理坐标为：东经81°34′—83°35′、北纬42°54′—43°38′，东南与和静县接壤，东北与新源县毗邻，北部同尼勒克县和伊宁县隔河相望，西部与察布查尔县相邻，南部与特克斯县相依，辖元面积4528平方公里。巩留县由山地、丘陵、平原三大地貌单元所组成，三者分别占巩留县总土地面积的67.05%、9.46%和21.93%。山地主要由伊什格力克和那拉提两大山系构成，其总面积为3100平方公里。那拉提山位于县境东南部，属天山南脉，东西走向，东起新源县，西至特克斯县，境内长达84公里。此山高大雄伟，海拔3500—4200米，最高峰喀班巴依峰海拔4257米，也是巩留县最高峰。